La Fundación Francisco Matto fue constituida por iniciativa de la Sra. Ada Antuña de Matto el 30 de diciembre de 2011. Sus estatutos fueron aprobados y reconocida su personería jurídica por resolución del Ministerio de Educación y Cultura de fecha 19 de abril de 2012, inscripta en el Registro de Asociaciones Civiles y Fundaciones el 25 de abril de 2012 con el Nº 11/2012.
Es el objetivo de la Fundación, la gestión del patrimonio artístico del maestro Francisco Matto en sus múltiples aspectos.
La difusión y el conocimiento de su obra y de su pensamiento es una tarea central de la Fundación. La colaboración con instituciones que organicen exposiciones en las que la presencia de la obra del maestro Matto sea requerida mediante el préstamo de obras propiedad de la Fundación es una de las herramientas para proyectar el legado de este artista.
La Fundación, en su carácter de propietaria de los derechos de autor de Francisco Matto, se encarga del otorgamiento de los permisos de reproducción de las imágenes de sus obras así como de velar por el buen uso de las mismas.
La certificación de sus obras y la confección de un archivo digital de las mismas, son tareas que han comenzado a ser desarrolladas. Se ha creado un protocolo de certificación que cumple con parámetros que garantizan la seguridad del procedimiento. Detectar la presencia de falsificaciones u obras mal atribuidas, no solo es fundamental para el correcto estudio y proyección futura de su obra sino que brinda un marco de seguridad y transparencia a los coleccionistas y al mercado.
Parte muy importante del legado de Francisco Matto es su colección de arte precolombino.
Esta colección que Matto comenzó a atesorar siendo muy joven fue calificada por UNESCO de manera especial por su originalidad en cuanto a que fue creada siguiendo un criterio puramente estético por un artista moderno que miraba la obra legada por los antiguos artistas americanos. La colección estuvo expuesta en un museo abierto al público entre los años 1962-1978.
Es uno de los cometidos centrales de la Fundación lograr que la Colección Matto de Arte Precolombino encuentre nuevamente un lugar adecuado para su exhibición pública, cumpliendo el fin social y educativo al que Matto aspiraba. Se están analizando diferentes propuestas para alcanzar este objetivo y existe la máxima apertura para considerar nuevas proposiciones, tanto desde el ámbito público como del privado.